Milieuzoneboetes worden opgelegd ter bescherming van de luchtkwaliteit in druk bevolkte stedelijke gebieden. Steden zoals Amsterdam, Rotterdam en Utrecht hebben milieuzones ingesteld waar alleen voertuigen met een bepaalde schoonheidsstandaard mogen rijden. Voertuigen met een Euro-norm onder de vereiste standaard (meestal Euro 4 of beter) krijgen een boete van meestal tussen 95 en 500 euro, afhankelijk van het voertuigtype.
Een milieuzone staat duidelijk aangegeven met blauwe borden en verkeersborden bij de stadsingangen. Bestuurders kunnen vooraf controleren of hun voertuig wel toegang heeft via de RDW-website of via diensten die emissiegegevens registreren. Het voertuig moet ingeschreven staan in het Nederlandse Register met een geldige Euro-classificatie. Vrachtwagens en bussen hebben soms eigen zones met strengere regels dan personenauto's.
Wie een milieuzoneboete ontvangt, kan deze aanvechten als het voertuig werkelijk niet in de milieuzone mocht rijden of indien de registratie verkeerd is. Ook gelden uitzonderingsregels voor bepaalde voertuigen, zoals hulpvoertuigen, diplomatieken en klassieke auto's. Een waarschuwingsbrief kan vooraf gegeven worden voor eerste overtredingen.